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Informaci\u00f3n proporcionada por el Ministerio de Sanidad del Gobierno de Espa\u00f1a.
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<\/p>\nEl Centro Nacional de Microbiolog\u00eda realiza la secuenciaci\u00f3n completa del SARS-CoV2 en muestras de pacientes de distintas partes de Espa\u00f1a \t\t\t
El estudio permite identificar mejor las distintas secuencias del virus en Espa\u00f1a<\/p>\n
31 de marzo de 2020. Cient\u00edficos del Laboratorio de Virus Respiratorios del Centro Nacional de Microbiolog\u00eda (CNM) del Instituto de Salud Carlos III (ISCIII) han realizado la secuenciaci\u00f3n completa del nuevo coronavirus SARS-CoV-2 gracias al uso de muestras respiratorias de pacientes procedentes de diferentes \u00e1reas geogr\u00e1ficas de Espa\u00f1a. Su trabajo, al aportar una secuencia muy completa y sin indeterminaciones, permitir\u00e1 conocer mejor las caracter\u00edsticas del virus, analizar peque\u00f1os cambios espec\u00edficos que definen su comportamiento y comprender mejor su circulaci\u00f3n y difusi\u00f3n entre la poblaci\u00f3n.<\/p>\n
Seg\u00fan explica Mar\u00eda Iglesias, investigadora del citado laboratorio, se ha logrado la secuencia del virus completo gracias al uso de nuevos m\u00e9todos de trabajo optimizados y desarrollados en el CNM para la secuenciaci\u00f3n completa del virus, entre los que se incluyen nuevos procesos de an\u00e1lisis bioinform\u00e1tico para la obtenci\u00f3n de las secuencias gen\u00f3micas del SARS-CoV-2. De acuerdo al conocimiento actual del virus, las secuencias del SARS-CoV-2 se agrupan en 9 \u2018clados\u2019 distintos. Los clados son grupos filogen\u00e9ticos que definen la evoluci\u00f3n biol\u00f3gica de un organismo, y en ellos se pueden observan las diferencias gen\u00e9ticas de los coronavirus circulantes de todo el mundo, que explican c\u00f3mo act\u00faa y se comporta. Seg\u00fan han determinado los investigadores del CNM, las secuencias espa\u00f1olas del SARS-CoV-2 se han relacionado en 3 clados diferentes, denominados S, G y V.<\/p>\n
El estudio de secuenciaci\u00f3n se ha realizado directamente sobre muestras cl\u00ednicas del virus (no con cultivos de laboratorio) con apoyo de las Unidades de Bioinform\u00e1tica y Gen\u00f3mica del CNM. Se ha llevado a cabo con muestras cl\u00ednicas procedentes de Pa\u00eds Vasco, Madrid, Andaluc\u00eda, Castilla-La Mancha, Castilla y Le\u00f3n, Catalu\u00f1a y Galicia, y permite observar un mapa de la circulaci\u00f3n y caracter\u00edsticas de circulaci\u00f3n del virus por toda Espa\u00f1a. Entre otras cuestiones, el an\u00e1lisis realizado permite caracterizar c\u00f3mo se relacionan las diferentes secuencias publicadas hasta el momento, tanto entre s\u00ed como con secuencias internacionales, y aporta nuevo conocimiento sobre la circulaci\u00f3n del virus a nivel auton\u00f3mico y nacional. Tambi\u00e9n revela informaciones m\u00e1s concretas, como la ubicaci\u00f3n de secuencias procedentes de Andaluc\u00eda en un clado distinto al del resto de secuencias espa\u00f1olas, que se asocian filogen\u00e9ticamente con secuencias procedentes de virus analizados en pacientes ingleses.<\/p>\n
Conocer mejor el virus para mejorar el manejo de la enfermedad<\/p>\n
El desarrollo y la validaci\u00f3n de nuevos m\u00e9todos de secuenciaci\u00f3n masiva permitir\u00e1n aumentar, en un futuro muy pr\u00f3ximo, el n\u00famero de secuencias espa\u00f1olas disponibles en las bases de datos procedentes de todas las comunidades aut\u00f3nomas. Haber logrado esta secuenciaci\u00f3n del SARS-CoV2 tambi\u00e9n facilitar\u00e1 el estudio de peque\u00f1os cambios espec\u00edficos del virus, comprender mejor su difusi\u00f3n y circulaci\u00f3n, y conocer m\u00e1s en profundidad sus caracter\u00edsticas gen\u00e9ticas.<\/p>\n
La secuenciaci\u00f3n llevada a cabo en el CNM \u201ces muy completa y ofrece informaci\u00f3n sin ning\u00fan tipo de indeterminaciones, lo que permitir\u00e1 su uso en estudios comparativos globales\u201d, explica Iglesias. La investigadora se\u00f1ala que esta secuencia ofrece m\u00e1s informaci\u00f3n en torno al virus, algo fundamental para poder desarrollar nuevas herramientas que mejoren el manejo de la enfermedad.<\/p>\n
Toda la informaci\u00f3n de las secuencias obtenidas por el CNM ya es de acceso p\u00fablico desde diferentes plataformas, como GISAID y Nextstrain, entre otras. En Espa\u00f1a hay otras iniciativas en torno a la secuenciaci\u00f3n completa del nuevo coronavirus, como, entre otras, la de la Comunidad de Madrid y un proyecto liderado por la Fundaci\u00f3n Fisabio de la Comunidad Valenciana, que ya obtuvo hace unas semanas una primera secuenciaci\u00f3n del virus, en su caso obtenido de tres muestras de un mismo hospital.
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Informaci\u00f3n proporcionada por el Ministerio de Sanidad del Gobierno de Espa\u00f1a.<\/p>\n
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